З 1996 року ЧНУ імені Петра Могили випускає науково-методичний журнал «Наукові праці», який отримав статус фахового за серіями:
Також видаються наступні фахові журнали:
Public Policy and Economic Development – спільно з Університетом імені Адама Міцкевича в Познані, Польща (наказ МОН України від 07.10.2015 № 1021), web-сторінка видання
Інвестиції: практика та досвід – спільно з ТОВ «ДКС Центр» (державне управління – наказ МОН України від 29.12.2014 № 1528, економічні науки – наказ МОН України від 13.07.2015 № 747), сайт видання
Історичний архів. Наукові студії – спільно з Інститутом української археографії та джерелознавства імені М.С.Грушевського НАН України (наказ МОН України від 07.10.2015 № 1021), web-сторінка видання
Чорноморський літопис – спільно з Інститутом історії НАН України (наказ МОН України від 11.07.2016 № 820), web-сторінка видання
Український журнал медицини, біології та спорту – спільно з Харківською медичною академією післядипломної освіти, Херсонським державним університетом (біологічні, медичні (за групою спеціальностей 14.03.00), наказ МОН України від 22.12.2016 № 1604), сайт видання
Інші наукові видання:
Науково-методичний журнал «Наукові праці» Серія:
Сучасна українська політика – спільно з Інститутом політичних та етнонаціональних досліджень імені І.Ф.Кураса НАН України, Асоціацією політичних наук України, ГО «Українська академія політичних наук», Українським центром політичного менеджменту.
З 1996 року наукове студентство університету випускає молодіжний науковий журнал «Студентські наукові студії» за напрямками: історія, політологія, економіка, екологія, філологія, який зареєстровано як наукове видання.
Вимоги до студентських наукових статей, що подаються для опублікування у молодіжному науковому журналі «Студентські наукові студії». Ознайомитися зі змістом даних видань можна на сайті видавництва ЧНУ імені Петра Могили.
