Діяльність ННІПО забезпечують 35 кафедр університету, де працюють більш ніж 373 викладачі, з яких 6 – заслужені діячі науки і техніки України, 8 – дійсні члени та члени-кореспонденти галузевих академій, 58 – доктори наук, 48  професорів, 200 кандидатів наук, 125 – доценти, 70 – аспіранти, 6 - докторанти, 3 – іноземні викладачі, навчально-методичні працівники, бібліотека ЧНУ імені Петра Могили, комп’ютерні та інформаційні центри.

Навчально-науковий центр соціально-психологічної підтримки, професійного розвитку та сприяння працевлаштуванню. До складу Центру входять:

• Центр тренінгових технологій
• Сервісний центр для студентів з особливими потребами (інклюзивна освіта)
• Центр сприяння працевлаштуванню
• Психологічний консультаційний центр
• Клуб студентів «Психологічний майданчик»
• Школа кураторів та молодих викладачів
• Центр волонтерства

Науковий дослідно-практичний центр з питань інклюзії та реабілітації Чорноморського національного університету імені Петра Могили.

• метою діяльності Центру є об'єднання зусиль науковців, фахівців та розробників обладнання для створення ефективних науково підтверджених корекційно-розвиткових заходів, поєднати технології використання сучасного інтерактивного обладнання з програмами, методами, методиками та обладнанням, які вже використовуються фахівцями в корекційно-розвитковій роботі з дітьми з особливими потребами, розповсюдити досвід серед фахівців інклюзивно-ресурсних центрів та навчальних закладів, які входять до Мережі інклюзивних інтерактивних осередків.

Миколаївський регіональний центр зайнятості;

Міжнародний благодійний фонд «Міжнародний Фонд Соціальної Адаптації»;

NORD Університет (м. Будо);

Департамент освіти і науки Миколаївської ОДА;

Департамент Соціального захисту населення Миколаївської ОДА;

Департамент праці та соціального захисту населення Миколаївської міської ради;

Міський центр підтримки внутрішньо переміщених осіб та ветеранів АТО.